هناك اختلاف كبير بالأمر فأنظمة الإدارة المتعارف عليها تقدم لنا إمكانية واضحة وقد تكون ببعض الأوقات محدودة قياساً للمتطلبات التي نرغب بالحصول عليها لذلك عند القيام بتنفيذ الفكرة ببرمجية خاصة نحصل على مساحة أكبر بعملية تنفيذ المتطلبات وأيضاً إمكانية أكبر في دراسة حالات التطوير المستقبل.

لا يمكن القول أنها سلبيات ولكن يمكن القول بأنها مخاطرة كبيرة في بعض الأوقات، فتنفيذ برمجية خاصة يعني الحاجة إلى المزيد من الوقت في عمليات التحليل والبناء والاختبارات وغيرها من الأمور التي يمكن توفيرها ببعض الأوقات عند الاعتماد على الأنظمة الشائعة ولكن جميع هذه المخاطر قد تكون بوقت لاحق في حال تجاوزها نقطة قوة تحسب للمشروع وخبرة إضافية يتم اكتسباها في عملية إدارة المشروع.

بكل تأكيد هناك اختلاف قد يكون هذا الاختلاف بزيادة أو بنقصان فالأمر يتعلق بشكل مباشر بالوقت الذي قد نكون بحاجة إليه لتنفيذ الفكرة فبعض الأفكار قد تكون سهلة ولا تحتاج للكثير من الوقت فقد يكون السعر بها أقل من البرمجيات المتعارف عليها وبعضها الأخر قد يكون أكثر تعقيداً ويحتاج للكثير من الوقت في عملية التنفيذ و بالتالي زيادة أكبر في السعر.